核磁處理軟件5

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1、MestreC WINNMR核磁處理軟件核磁處理軟件 核磁數據處理軟件核磁數據處理軟件 有：NUTS、MestRe-C、Gifa等；NUTS可以處理一維及二維核磁數據，其功能包括付立葉變換、相位校正、差譜、模擬譜、勻場練習等幾乎所有核磁儀器操作軟件的功能；其演示版在http:/下載MestRe-C為處理一維二維核磁數據的免費軟件，功能完善。其最新版本為2.3，有興趣可在http:/qobrue.usc.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.html處查看有關信息即下載；或所內網站上下載；Gifa可以處理一至三維核磁數據，為運行在LINUX操作系統中X-Window上的免費軟

2、件，有關信息可查看http:/www.cbs.univ montp1.fr/GIFA核磁處理軟件核磁處理軟件MestreC 軟件安裝軟件安裝l從ftp上下載軟件，安裝完畢后，將crack軟件解壓縮后將其拷貝到安裝程序所在文件夾，覆蓋原文件即可獲取核磁數據獲取核磁數據l軟件本身帶有一個ftp客戶端軟件l可以從網絡下載數據打開已經下載的數據打開已經下載的數據l軟件可以自動識別核磁數據的格式（不同儀器產生的數據格式不同）l對于所有的儀器，原始的核磁數據文件名為fidl對于bruker儀器產生的數據，因其可以保存處理好的數據，可由Mestre-C軟件直接打開，文件名1D為 1r，2D為 2rr核磁數據

3、的目錄結構核磁數據的目錄結構lBruker儀器：文件名編號，原始數據存儲在這個文件夾中Fileopen文件所存盤文件名樣品編號pdata處理編號文件類型(all files)文件名1D為 1r，2D為 2rr，處理過的數據存儲在這個文件夾中一維數據處理的步驟一維數據處理的步驟1.打開原始數據文件 fid文件，是一個遞減的波形文件2.進行傅立葉變換，設置參數，最重要的是set functions中的第一個參數（窗函數）3.調整相位4.基線校正5.積分，定標，標記化學位移等譜圖處理設置窗函數譜圖處理設置窗函數l單擊ft按鈕，在對話框中點擊set function(s)l在打開的對話框中，修改exp

4、onentia的值缺省是0.5Hz，增加此項數值將會是峰型變寬，但可消除裂分相位校正相位校正l可選擇自動相位校正l如果效果不好，可使用手動校正點擊手動相位校正按鈕在對話框中點擊biggest按鈕在對話框中間部分按住鼠標左鍵，調整最高峰附近的峰的相位在對話框中間部分按住鼠標右鍵，調整遠離最高峰的其他峰的相位調到峰行對稱基線校正基線校正l點擊工具按鈕上基線校正按鈕，在菜單中選擇full auto即可核磁畫圖核磁畫圖 可以不做以上操作直接進入圖譜按以下操作進行圖譜處理。1D處理處理標記峰標記峰定標定標積分積分譜圖顯示譜圖顯示2D處理處理標記峰標記峰找出變換好的圖譜路徑如下：lFileopen文件所存

5、盤文件名樣品編號pdata文件類型（所有文件all files）文件名1D為 1r，2D為 2rrl1D點擊Peak Picking按鈕，使用鼠標在譜圖中進行標記 點擊Peak Picking按鈕，使用鼠標選中（框?。┰谧V圖中進行標記化學位移保留小數點后位：化學位移保留小數點后位：options/properties/peak pick/decimal測試參數顯示雙擊鼠標左鍵跳出對話框選擇show spectrum parameter/ok上面有儀器頻率定標定標如果化學位移出現偏差，可使用工具條上標有TMS的按鈕進行定標：單擊TMS按鈕，鼠標指針變為十字型在標準峰上單擊鼠標在彈出的對話框中輸入

6、化學位移值積分積分l點擊積分按鈕，使用鼠標進行積分l可使用自動積分l積分值可以到出到文件點擊積分按鈕，按住鼠標左鍵拉動進行積分譜圖顯示譜圖顯示l可使用工具按鈕上有關譜圖顯示的按鈕進行譜圖放大，縮小等操作Mestre-C有關參數的設置有關參數的設置l窗口背景，optionssetingl譜圖參數，optionsproperties找出變換好的圖譜路徑如下：lFileopen文件所存盤文件名樣品編號pdata文件類型（所有文件all files）文件名1D為 1r，2D為 2rr2D 處理處理2D粘貼粘貼1D：從上面圖標上點擊：從上面圖標上點擊setup 1D Traces 再從跳出的再從跳出的對

7、話框中點擊對話框中點擊lead from disk選擇選擇1D查找范圍，樣品所在，查找范圍，樣品所在，樣品名，圖譜編號樣品名，圖譜編號pdat/1r雙擊。雙擊。調整調整1D：如圖按左邊對話進行調整。選中1D上邊（或左邊），雙擊鼠標左鍵跳出對話框用箭頭調整1D2D校正校正：advance/shift spectrum vector/points to 增減。添加方框線添加方框線：options/setting/gride.選為黑色選為黑色 畫圖：畫圖：選擇從上面圖標上點擊紅色方框，再從跳出的對話框中點擊紅色方框圖旁邊的第二個圓圈圖。2D去邊框：去邊框：粘貼好1D后，選中1D上邊（或左邊），點擊鼠

8、標右鍵/properties/set/none/ok/apply/ok2D去邊框：去邊框：粘貼好1D后，選中1D上邊（或左邊），點擊鼠標右/properties/set/none/ok/apply/okNOESY,QC需要照以下路徑操作：需要照以下路徑操作：界面左邊lev/negative 調為（）C 和DEPT1.依次打開依次打開C和和 DEPT；2.將將C譜取峰，校正，確定譜取峰，校正，確定C譜范圍；譜范圍；3.將將DEPT打開，并確定成與打開，并確定成與C譜相同范圍譜相同范圍4.將將C譜復制譜復制edit/copy spectrum5.在打開的在打開的DEPT中將復制的中將復制的C譜粘貼

9、譜粘貼6.在工具欄在工具欄stack7.隨后通過工具欄隨后通過工具欄“左右居左右居”中將兩張譜對齊中將兩張譜對齊8.以下操作類推即可，此時需用以下操作類推即可，此時需用edit/select all spectrum 工具選擇所用圖譜，然后再工具選擇所用圖譜，然后再copy分別打開13和dept，固定化學位移路徑如下，view/zoom/manual zoom取消dept中的橫坐標和縱坐標，擊鼠標右擊properties/vertical scale(horz scale)/選擇show scale,取消dept中的邊界線，擊鼠標右擊properties/spectrum/spectrum b

10、orders/set/none/ok將將C譜復制譜復制edit/copy spectrum在新打開文件中，再把在新打開文件中，再把DEPT復制至其中，拉動邊框使其左右對齊，復制至其中，拉動邊框使其左右對齊，做好的13C dept核磁處理軟件核磁處理軟件WINNMR 網絡版網絡版WINNMR軟件軟件l 從ftp上下載該軟件l 在安裝界面中選擇安裝：l WINNMR 1D：1D Post processingl WINNMR 2D：2D Post processingl WIBu key 2.52asoftware protectionl 安裝完后在c:windowsd2nmr.init中加入l

11、settingsl Network=1l Nethasp=1網絡版WINNMR軟件此軟件對1D譜放大及DEPT畫圖較好。l找出變換好的圖譜路徑如下：lFileopen文件所存盤文件名樣品編號1D為1r，2D為 2rr點開l1D點擊Peak Picking按鈕，使用鼠標在譜圖中進行標記l添加圖譜參數output/acpu從里面選擇所需參數/show select/ok標記峰標記峰圖譜路徑如下analysis/peapking/pc/ok;點擊對圖譜調整添加圖譜參數output/acpu從里面選擇所需參數。l analysis/peak picking/pc/ok/mouse pp框出所 需的峰/

12、returnlanalysis/Calibration/calibraic/returnlanalysis/integration/點擊積分按鈕，使用鼠標左鍵右鍵把光標放到最小的峰上進行積分/return/yesl打印output/printer set up/set up/布局/橫向/確定/ok (此設置好后即可）標峰、校準及積分路徑如下:調整圖譜調整圖譜l 點擊左邊點擊左邊previewl 鼠標左鍵選中圖譜，向左拉動右邊邊框，再用鼠標左鍵選中參數欄，將其拖到圖譜右邊。l 鼠標左鍵選中圖譜，向上下、左右拉動邊框，用鼠標點擊*2/2調整圖譜峰高。打印打印:點擊preview/yes 選中參數把

13、參數拖到適當位置print or edit/copy到word，點擊界面左上角nmr zoom 進行放大C 和和DEPTl 按照氫譜做法打開碳譜，進行校準標峰后點擊preview雙擊鼠標左鍵跳出對話框把xstar和xstop化學位移固定，把顏色改為黑色點擊ok，再file/save metafile/確定/yes儲存，return。l 照上述操作打開dept/preview/調整圖譜放在中間，刪除參數，雙擊取消axis、fram，選定star、stop/ok/在file/open metafile/確定 調整13C/save metafile/確定/yes Fileopen文件所存盤文件所存盤

14、文件名文件名碳譜編號碳譜編號1r analysis/peak picking/pc/ok/mouse pp框出所需的峰框出所需的峰 點擊preview雙擊鼠標左鍵跳出對話框把xstar和xstop化學位移固定固定譜寬化學位移 鼠標左鍵選中圖譜，向左拉動右邊邊框，再用鼠標左鍵選中參數欄，將其拖到圖譜右邊。鼠標左鍵選中圖譜，向下拉動上邊邊框，縮小到頁面1/3處，用鼠標點擊*2/2調整圖譜峰高。鼠標 照上述操作打開照上述操作打開dept/preview/調整圖譜放在中間，刪除參數，雙擊調整圖譜放在中間，刪除參數，雙擊取消取消axis、fram，選定，選定star、stop固定化學位移固定化學位移/o

15、k/在在file/open metafile/確定確定 調整調整dept/save metafile/確定確定/yes*2/2調整譜峰度調整譜峰度 拉大、縮小邊框拉大、縮小邊框 選中取消選中取消 照上述操作打開dept135/preview重復上述操作/open metafile/確定 調整13C/print or copy到2D處理處理 l找出變換好的圖譜路徑如下：lFileopen文件所存盤文件名樣品編號2rrl粘貼1r圖譜路徑如下：lUtilities/f1-axis ext/文件所存盤/文件名/樣品編號/pdata處理編號/文件類型(all files)/1r/acceptlUtili

16、ties/f2-axis ext/文件所存盤/文件名/樣品編號/pdata處理編號/文件類型(all files)/1r/accept 可以拉大邊框對圖譜大小調整，拉后要選中上邊和左邊的1D調整，點擊右面automatic factor改為2調整畫面。放大圖譜只要用鼠標框中2D在點擊鼠標左右鍵,然后分別用鼠標點擊上邊和左邊的1D調整，通過點擊一邊把一邊變為灰色，另一邊變為藍色進行調整（灰色不變，藍色變）。打印要把右面colors設置為黑色 對于2D(hsqc、roesy)需要點擊左上角/對正負面選擇恰當的一面進行處理。下圖為點擊/前 處理前圖譜不理想，處理后較好圖譜，下圖為點擊/后打印設置打印設置l要把打印output/printer set up/set up/布局/橫向/確定/ok (一此設置好后即可）或者在preview里面output/printer set up/set up/布局/橫向/ok (一此設置好后即可）l要點擊colors/monochrom變為黑色MestreC軟件對2D圖譜處理較為方便。網絡版網絡版WINNMR軟件軟件對1D圖譜處理較為方便，特別適用DEPT圖譜的處理，該軟件只能在所內區域網上使用。